Антивирус для сайта от yandex - manul.

Антивирусная утилита, которая собирает структурированную информацию о сайте. Собранные данные можно отправить специалисту или проанализировать самостоятельно, чтобы получить лечащий скрипт.
Manul легко установить. Ему не нужен доступ к учётным записям администратора. После окончания работы вы просто удаляете с сервера папку с антивирусом.
Для запуска Manul на сервере должна быть полноценная поддержка PHP версии 5.2 и выше.
https://yandex.ru/promo/manul#about